Líneas de investigación:
Biosistemática, Taxonomía Molecular, Evolución de Angiospermas, Informática de la Biodiversidad.
Proyectos:
Proyecto FONCDECYT de Iniciación (11220556) (Chile): Is Hybridization A Plausible Mechanism Of Diversification In Alstroemeria?: Unraveling A Case Of Directional Introgression And Chloroplast Capture In The A. Ligtu – A. Hookeri Species Complexes.
Proyecto CONICYT PAI 77190055 (Chile): “Fortalecimiento del estudio de la diversidad biológica a través de la implementación de aproximaciones genómicas en la sistemática y taxonomía de plantas vasculares de la flora de Chile” (2019-2022).
Proyecto FONDECYT Postdoctoral Nº 3160453 (Chile): “Uso de taxonomía integrativa en el subclado Atacama de Schizopetalon (Brassicaceae): dirigiendo los pasos hacia una aproximación holística en la identificación de entidades y de sus procesos evolutivos en el Desierto de Atacama”. (2015-2017).
Proyecto FONDECYT Nº 1130349 (Chile) “A morphological, molecular and cytogenetic overview of some species complexes of the genus Alstroemeria L. (Alstroemeriaceae) in Chile (2016).
Proyecto CONACYT Nº 288690 (México) “El papel del nicho ecológico y los refugios pleistocénicos en el mantenimiento de la diversidad genética de una planta hemiparasita del Desierto Sonoriense”. (2018-2021).
Publicaciones (Últimos 5 años):
- Varas-Myrik A., Sepulveda-Espinoza F., Toro-Núñez O., Fajardo A., Alarcón D. & R. Hasbún. 2024. Using a genomic offset approach to guide assited gene flow in the South American conifer Araucaria araucana. Forest Ecology and Management 553, 121637. DOI: https://doi.org/10.1016/j.foreco.2021.119856
- Baeza Perry C., Rojas G., Toro-Núñez Ó & E. Ruiz. 2023. The fundamental karyotype and plastid DNA of Alstroemeria piperata (Liliales, Alstroemeriaceae), a species endemic to the Valparaíso Region, Chile. Phytotaxa 629(2):139-146.https://doi.org/10.11646/phytotaxa.629.2.3
- Villalobos N.I., Finot V.L., Toro-Núñez O., Baeza C., Ruiz E., Carrasco P., Campos J. & P. Melín. 2023. Morpho-colorimetric characterization of the perigonium of the Alstroemeria pulchra complex (Alstroemeriaceae, Alstroemerieae) as an aid to delimit its infraspecific taxa. Pytotaxa 622(3): 173-190. 11646/phytotaxa.622.3.1
- Hendriks K.P., Kiefer Ch.; Al-Shehbaz I.A., Bailey C.D., Hooft van Huysduynen A., Nikolov L.A., Nauheimer L. Zuntini A.R., German, D.A., Franzke A. Koch M.A., Lysak M.A. Toro-Núñez Ó., Özüdoğru B., Invernón V.R., Walden N. Maurin O., Hay N.M., Shushkov P., Mandáková T. Thulin M., Windham M.D., Rešetnik I., Španiel S., Ly E., Pires J.C., Harkess A., Neuffer B., Vogt R., Bräuchler C., Rainer H., Janssens S.B., Schmull M., Forrest A., Guggisberg A., Zmartzy S., Lepschi B.J., Scarlett N., Stauffer F.W. Schönberger I., Heenan P., Baker W.J., Forest F., Mummenhoff K., & F. Lens. 2023. Global Brassicaceae phylogeny based on filtering of 1,000 gene dataset. Current Biology 33, 1–17. https://doi.org/10.1016/j.cub.2023.08.026
- Fuica-Carrasco C., Toro-Núñez Ó., Lira-Noriega A., Pérez A. & V. Hernández. 2023. Metabolome expression in Eucryphia cordifolia populations: Role of seasonality and ecological niche centrality hypothesis. Journal of Plant Research 136: 827-839. https://doi.org/10.1007/s10265-023-01483-3
- Sepulveda-Espinoza F., Bertin-Benavides A., Hasbún R., Toro-Núñez O., Varas-Myrik A., Alarcón D. & M. Guillemin. 2022. “Impact of pleistocene glaciations and environmental gradients on Embothrium coccineum genetic structure” Ecology and Evolution. 12(11): e9474. https://doi.org/10.1002/ece3.9474
- Varas-Myrik A., Sepúlveda-Espinoza F., Fajardo A., Alarcón D., Toro-Núñez Ó, Castro-Nallar E. & R. Hasbún. 2022. Predicting climate change-related genetic offset for the endangered southern South American conifer Araucaria araucana. Forest Ecology and Management 504: 119856. https://doi.org/10.1016/j.foreco.2021.119856
- Hendricks K, Mandáková T., Hay N.M., van Huysduynen A.H., Tamrakar R., Thomas S.K., Toro-Núñez O., Pires J.C., Nikolov L.A., Koch M.A., Windham M.D., Lysak M.A., Forest F., Mummenhoff K., Baker W.J. Lens F. & Bailey C.D. 2021. The best of both worlds: combining lineage specific and universal bait set in target enrichment hybridization reactions. Applications in Plant Science 9(7): 11438. DOI: 10.1002/aps3.11438
- Escobar I., Ruiz-Ponce E., Rudall P.J., Fay M.F., Toro-Núñez O., Villalobos-Barrantes H. & C.M. Baeza. 2020. Phylogenetic relationships based on nuclear and chloroplast DNA sequences reveal diversification and discordant patterns of morphological evolution of the Chilean genera of Gilliesieae (Amaryllidaceae: Allioideae). Botanical Journal of the Linnean Society 194(1): 84-99. DOI: https://doi.org/10.1093/botlinnean/boaa035
- Toro-Núñez O.&. Lira-Noriega A. 2020. Discordant phylogenetic endemism patterns in a recently diversified Brassicaceae lineage from the Atacama Desert: When choices in phylogenetic and species distribution information matter. Journal of Biogeography 47(8): 1792-1804. DOI: https://doi.org/10.1111/jbi.13846.
- Baeza C.M., Toro-Núñez O., Cacho N.I., Cuba-Díaz M., Urtubey E., Ponce-Ruiz E., Araneda-Beltrán C. & T. Stuessy. 2019. IAPT/IOPB Chromosome Data 30/4. In: Marhold K. & al. (eds.), IAPT chromosome data 30. Taxon 38 (5): 1124-1130.
- Molina-Mercader G., Angulo A.O., Olivares T.S., Sanfuentes E., Castillo-Salazar M., Rojas E., Toro-Núñez O., Benítez H.A. & R. Hasbún. 2019. Ophelimus migdanorum Molina –Mercader sp. Nov. (Hymenoptera: Eulophidae): Application of integrative taxonomy for dissentangling a polyphenism case in Eucalyptus globulus Labill forests from Chile. Forests 10(9): 720.
- Baeza, C.M., Rodríguez, R.R. & O.Toro-Núñez. 2019. Catálogo de las plantas vasculares de la Laguna Avendaño, Provincia del Ñuble, Chile. Gayana Botánica76 (1): 74-83. Baeza, C.M. Toro-Núñez O., Ruiz E., Finot V., Carrasco P. & N. Villalobos. 2018. Polimorfismo entre cromosomas homólogos, un caso extremo en Alstroemeria pulchra (Alstroemeriaceae), especie endémica de Chile. Gayana Botánica 75(2): 663-666.
Congresos Internacionales:
- 67th Congreso Brasilero de Genética, Natal, Brasil.
- Nascimiento J., Sader M., Toro O., Baeza C. & A. Pedrosa-Harand. 2022. Similar but different: Stability in genomic composition but differences in satellite DNA abundances between Brazilian and Chilean species of the genus Alstroemeria Presentación Panel.
- XII Congreso Latinoamericano de Botánica, Quito, Ecuador.
- Toro-Núñez, O. & A. Lira-Noriega. 2018. Ejemplo de cómo la incongruencia filogenética y el método de estimación de especies podrían impactar en el patrón de endemismo filogenético de la flora del Desierto de Atacama (Chile). Presentación Oral.
Congresos Nacionales (Últimos 5 años):
- XXXII Reunión Anual Sociedad de Botánica de Chile, Los Angeles, Chile
Organizador Simposio II: Patrones de Evolución y Diversificación de Alstroemerias Chilenas
Baeza-Perry C., Rojas G., Toro-Núñez O. & E. Ruiz-Ponce. 2023. Análisis del cariotipo en Alstroemeria piperata A.R. Flores & J.M. Watson. Presentación Oral.
Carrasco-Muñoz P., Toro-Núñez O., Nascimiento J., Pedrosa-Harand A., Avria-Llautureo J., Sader M. Ruiz-Ponce E & C.M. Baeza. 2023. Relaciones filogenéticas y propuesta de clasificación de Alstroemerias chilenas, basadas en el ADN cloroplastidial. Presentación Oral.
Díaz-Sanchez G., Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Ruiz-Ponce E. & C. Baeza. 2023. Caracterización de patrones de variación y señal filogenética en el plastoma de Alstroemerias chilenas. Presentación Oral.
Urra-Morales F., Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Ruiz-Ponce E. & C.M. Baeza. 2023. Efecto de la variación intragénica en la reconstrucción filogenética de Alstroemerias chilenas con el ITS del Cistrón Nuclear Ribosomal. Presentación Oral.
Ruiz-Lozano A., Toro-Núñez O., Takayama K., Lee C-K., Noda H., Carrasco-Muñoz P., Ruiz-Ponce E. & C.M. Baeza. 2023. Análisis de MIG-Seq revela estructura genética y filogenética en el complejo Alstroemeria hookeri Lodd. y especies afines (Alstroemeriaceae). Presentación Oral.
Toro-Núñez O., Arens P., Carrasco-Muñoz P., Esselink D., Orellana-King C.I., Ruiz-Ponce E. & C.M. Baeza. 2023. Desarrollo y generación de barcodes taxonómicos moleculares para el género Alstroemeria L. (Alstroemeriaceae). Presentación Oral.
- XXXI Reunión Anual Sociedad de Botánica de Chile, Putaendo, Chile
Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Nascimiento J., Sader M., Pedrosa-Harand A., Baeza C.M. & E. Ruiz-Ponce. 2022. Analisis comparativo del genoma cloroplastidial y del cistrón ribosomal nuclear suguiere precaución en el uso de marcadores moleculares con utilidad taxonómica en Alstroemeria (Alstroemeriaceae). Presentación Oral.
- VIII Congreso de la Asociación de Investigadores en Comunicación (INCOM), Viña del Mar, Chile
Neria-Mellado C., Vernier M., Cárcamo-Ulloa L., Toro Núñez O. & C. Muñoz-Escobar. 2022. Una verdad incómoda: Tópicos de Biodiversidad en medios de comunicación online. Presentación Oral.
- VII Congreso Iberoaméricano de Química de Productos Naturales, Puerto Natales, Chile
Fuica C,. Toro O., Pérez A. & Hernandez V. 2021. Composición química y actividad biológica en poblaciones de Eucryphia cordifolia (Cunoniaceae) distribuidos en el sur de Chile.
- Reunión Anual Conjunta LXII Sociedad de Biología de Chile, XIII Sociedad Chilena de Evolución, XXVI Sociedad de Ecología de Chile y XXX Sociedad de Botánica de Chile. No presencial
Toro-Núñez Ó., Baeza C.M., Ruiz-Ponce E., Hasbún R. & M.E. Mort. 2021. Resolución y soporte en relaciones intra e interespecíficas en la flora de Atacama en Chile: Experiencia de estudio filogenómico con MSG en el subclado Atacama de Schizopetalon (Brassicaceae). Presentación oral.
Neira-Mellado C., Toro-Núñez Ó., Muñoz-Escobar C., Lira-Noriega Á., Vernier M. & L. Carcamo-Ulloa. 2021. ¿Hotspot o hot-topic?: Tratamiento de la biodiversidad en los medios digitales de Chile y parte de Latinoamérica mediante análisis de texto cuantitativo. Presentación oral.
Ruiz-Ponce E. Toro-Núñez Ó., Baeza C.M., Rodríguez R. & E. Escobar. 2021. El Uso de Next Generation Sequencing (NGS) en el estudio de la diversidad genética y estructuración poblacional de Valdivia gayana (Escalloniaceae), una especie endémica y con problemas de conservación de la flora de Chile. Presentación oral.
Villalobos N. Baeza C.M., Toro-Núñez Ó., Ruiz-Ponce E. & V. Finot-Saldías. 2021. Colorimetría y morfometría geométrica del perianto como herramientas taxonómicas en Alstroemeria pulchra (Alstroemeriaceae) y taxones afines. Presentación poster.
Baeza C.M. Toro-Núñez Ó., Villalobos N. & Ruiz E. 2021. El complejo Alstroemeria pulchra Sims (Alstroemeriaceae) analizado citotaxonómicamente. Presentación oral.
- LIII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile. No presencial.
Sepúlveda Espinoza F., Bertín Benavides A., Hasbún Zaror R., Toro Núñez O. & D. Alarcón. 2020. Genotyping-by-Sequencing da nuevas señales sobre la estructura genética y la adaptación local de Embothrium coccineum: una especie emblemática de los bosques templados de Chile. Presentación Oral.
- Reunión Anual Conjunta LXII Sociedad de Biología de Chile, XIII Sociedad Chilena de Evolución, XXVI Sociedad de Ecología de Chile y XXX Sociedad de Botánica de Chile, Valdivia, Chile.
Toro-Núñez O., Rodríguez-Ríos R., Ruiz-Ponce E. & C.M. Baeza. 2019. Avances en la conservación de la rara y vulnerable Valdivia gayana Remy (Escalloniaceae, Escalloniales): Nuevos registros de poblaciones en Chile y primer registro genómico-organelar del orden Escalloniales. Presentación Oral.
Muñoz-Escobar Ch., Muñoz-Ramírez C., Toro-Núñez O., Pincheira-Solís M., Rivera L., Vega K., D´Elia G. & P. F. Victoriano. 2019. Canción de Agua y Barro: Linajes y territorios de los camarones de vega en Chile. Presentación Oral.
Sepúlveda-Rojas V., Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Ruiz-Ponce E., Villalobos N.I., Finot V.L. & C.M. Baeza. 2019. Validación de subunidades intraespecíficas en el complejo Alstroemeria philippi L. (Alstroemeriaceae) mediante el uso de secuencias cloroplastidiales. Presentación Panel.
Fernández-Alarcón N., Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Villalobos N.I., Ruiz-Ponce E., Finot V.L. & C.M. Baeza. 2019. Análisis morfométrico comparativo de tépalos en el complejo Alstroemeria ligtu L. (Alstroemeriaceae), mediante morfometría lineal y descomposición de formas elípticas de Fourier. Presentación Panel.
Ruiz-Ponce E., Baeza C.M., Toro-Núñez O., Carrasco-Muñoz P., Villalobos N.I. & V.L. Finot. 2019. Rol de las aproximaciones integrativas en la delimitación de taxones en complejos del género Alstroemeria L. usando diferentes fuentes de evidencia. Simposio “Uso de taxonomía integrativa en la delimitación de especies en complejos de especies de Alstroemeria Chilenas”
- XIV Congreso de la Asociación de Estudiantes de Biología de Chile, Santiago, Chile.
Caro-Contreras, J. & O. Toro-Núñez. 2019. Estudio fenológico comparativo basado en NDVI de poblaciones de Schizopetalon (Brassicaceae) usando datos de percepción remota con el modulo satelital MODIS. Presentación Panel.
- VII Congreso Chileno de Ciencias Forestales, Concepción, Chile
Hasbún, R., González, J., Bertín, A., Alarcón, D., Santelices, R., Sepúlveda, F., Varas, A. & O. Toro-Núñez. 2019. Aportes a la Genotipificación por Secuenciación de genoma reducido (GBS) a la genómica de poblaciones en especies forestales nativas de Chile. Presentación Oral.
- XL Congreso Nacional de Entomología, Concepción, Chile
Molina-Mercader, G.,Angulo, A.O., Olivares, T.S., Sanfuentes, E., Castillo-Salazar, M., Hasbún, R., Rojas, E., Toro-Núñez, O. & Benítez, H.A. 2019. Ophelimus migdanorum Molina-Mercader sp. nov. (Hymenoptera: Eulophidae): Aplicación de Taxonomia Integrativa para desenredar un paso de polifenismo en plantaciones de Eucalyptus globulus Labil: Su distribución en Chile y la de su posible biocontrolador Clostocerus chamaleon (Hymenoptera: Eulophidae). Presentación Oral.